Контигуудыг шатан дээр хэрхэн угсардаг вэ?
Контигуудыг шатан дээр хэрхэн угсардаг вэ?

Видео: Контигуудыг шатан дээр хэрхэн угсардаг вэ?

Видео: Контигуудыг шатан дээр хэрхэн угсардаг вэ?
Видео: Уншлага, контиг, шат гэж юу вэ? 2024, Арваннэгдүгээр
Anonim

Ноорог геномыг бүтээхдээ ДНХ-ийн хувь хүний уншилтыг хамгийн түрүүнд хийдэг контиг болгон угсарсан , тэдгээрийн мөн чанараар угсралт , тэдгээрийн хооронд зай завсар байна. Дараагийн алхам бол руу дараа нь эдгээрийн хоорондох зайг холбоно contigs to бүтээх тавцан . Үүнийг оптик зураглал эсвэл хос хосын дарааллыг ашиглан хийж болно.

Үүний нэгэн адил, та contigs болон scaffolds гэж юу вэ?

А тавцан нь төгсгөлийн дараалал бүхий бүхэл геномын бууны клонуудаас сэргээн босгосон геномын дарааллын нэг хэсэг юм. Шатнууд -аас бүрддэг contigs болон цоорхой. А contig нь суурийн дараалал нь найдвартай өндөр түвшинд мэдэгддэг геномын дарааллын залгаа урт юм. Зарим тохиолдолд, шатууд давхцаж болно.

Мөн биоинформатикт контиг гэж юу вэ? А contig (зэргэлдээх хэсгээс) нь ДНХ-ийн зөвшилцлийн бүсийг төлөөлдөг давхардсан ДНХ сегментүүдийн багц юм. Контиг Тиймээс энэ нь контекстээс хамааран давхардсан ДНХ-ийн дараалал болон клонд агуулагдах давхардсан физик сегментүүдийг (фрагментуудыг) хоёуланг нь илэрхийлж болно.

Үүнтэй холбогдуулан контигуудыг хэрхэн угсардаг вэ?

ДНХ-ийн хэсгүүдийн давхцаж буй ДНХ дарааллын багцыг a гэж нэрлэдэг contig . Контиг зураглал нь давхцаж буй клонуудын үйл явц юм угсарсан давхцах дарааллыг тогтоох. Үүнд зохион байгуулалт орно contigs дараалал, чиг баримжаагаар. Клон contigs автоматаар байж болно угсарсан Тэдний BAC төгсгөлийн дарааллыг ашиглан.

Контиг яагаад чухал вэ?

Контиг угсралт нь чухал геномын угсралтын алхам. Зураглал хийхдээ давхцаж буй клонуудыг дарааллаар нь угсардаг. Фрагмент бүрийг векторт хувилж, хоёр үзүүрээс нь дараалуулж, дарааллын урт нь ойролцоогоор 600-700 bp үүсгэдэг. ДНХ-ийн фрагментийн хоёр төгсгөлийн дарааллыг хос төгсгөл гэж нэрлэдэг.

Зөвлөмж болгож буй: